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mardi 26 avril 2022

Baculites asperiformis


Optimisation des colonies bactériennes/Optimisation des colonies bactériennes :
L'algorithme d'optimisation des colonies bactériennes est un algorithme d'optimisation basé sur un modèle de cycle de vie qui simule certains comportements typiques des bactéries E. coli tout au long de leur cycle de vie, notamment la chimiotaxie, la communication, l'élimination, la reproduction et la migration.
Conjugaison bactérienne/Conjugaison bactérienne :
La conjugaison bactérienne est le transfert de matériel génétique entre des cellules bactériennes par contact direct de cellule à cellule ou par une connexion en forme de pont entre deux cellules. Cela se fait à travers un pilus. C'est un mode de reproduction parasexuel chez les bactéries. Il s'agit d'un mécanisme de transfert horizontal de gènes, tout comme la transformation et la transduction, bien que ces deux autres mécanismes n'impliquent pas de contact de cellule à cellule. La conjugaison bactérienne E. coli classique est souvent considérée comme l'équivalent bactérien de la reproduction sexuée ou de l'accouplement puisqu'elle implique la échange de matériel génétique. Cependant, il ne s'agit pas de reproduction sexuée, puisqu'aucun échange de gamètes ne se produit, et en fait aucune génération d'un nouvel organisme : à la place, un organisme existant est transformé. Au cours de la conjugaison classique d'E. coli, la cellule donneuse fournit un élément génétique conjugatif ou mobilisable qui est le plus souvent un plasmide ou un transposon. La plupart des plasmides conjugatifs ont des systèmes garantissant que la cellule receveuse ne contient pas déjà un élément similaire. L'information génétique transférée est souvent bénéfique pour le receveur. Les avantages peuvent inclure la résistance aux antibiotiques, la tolérance aux xénobiotiques ou la capacité d'utiliser de nouveaux métabolites. D'autres éléments peuvent être nuisibles et peuvent être considérés comme des parasites bactériens. La conjugaison chez Escherichia coli par zygogenèse spontanée et chez Mycobacterium smegmatis par transfert conjugal distributif diffère de la conjugaison classique mieux étudiée de E. coli en ce que ces cas impliquent un mélange substantiel des génomes parentaux.
Affichage bactérien/Affichage bactérien :
L'affichage bactérien (ou affichage de bactéries ou affichage de surface bactérienne) est une technique d'ingénierie des protéines utilisée pour l'évolution in vitro des protéines. Les bibliothèques de polypeptides affichées à la surface des bactéries peuvent être criblées en utilisant la cytométrie en flux ou des procédures de sélection itératives (biopanning). Cette technique d'ingénierie des protéines permet de lier la fonction d'une protéine au gène qui la code. L'affichage bactérien peut être utilisé pour trouver des protéines cibles avec les propriétés souhaitées et peut être utilisé pour fabriquer des ligands d'affinité qui sont spécifiques aux cellules. Ce système peut être utilisé dans de nombreuses applications, notamment la création de nouveaux vaccins, l'identification de substrats enzymatiques et la recherche de l'affinité d'un ligand pour sa protéine cible. L'affichage bactérien est souvent couplé à des techniques de tri cellulaire activé magnétiquement (MACS) ou de tri cellulaire activé par fluorescence (FACS). Les méthodes concurrentes pour l'évolution des protéines in vitro sont la présentation de phages, la présentation de ribosomes, la présentation de levures et la présentation d'ARNm. L'affichage bactériophage est le type de système d'affichage le plus couramment utilisé, bien que l'affichage bactérien devienne de plus en plus populaire à mesure que les défis techniques sont surmontés. L'affichage bactérien combiné au FACS présente également l'avantage d'être une technique en temps réel.
Protéine_effectrice bactérienne/Protéine effectrice bactérienne :
Les effecteurs bactériens sont des protéines sécrétées par des bactéries pathogènes dans les cellules de leur hôte, généralement à l'aide d'un système de sécrétion de type 3 (TTSS/T3SS), d'un système de sécrétion de type 4 (TFSS/T4SS) ou d'un système de sécrétion de type VI (T6SS). Certaines bactéries n'injectent que quelques effecteurs dans les cellules de leur hôte tandis que d'autres peuvent en injecter des dizaines voire des centaines. Les protéines effectrices peuvent avoir de nombreuses activités différentes, mais aident généralement l'agent pathogène à envahir les tissus de l'hôte, à supprimer son système immunitaire ou à aider l'agent pathogène à survivre. Les protéines effectrices sont généralement essentielles à la virulence. Par exemple, chez l'agent causal de la peste (Yersinia pestis), la perte du T3SS est suffisante pour rendre les bactéries complètement avirulentes, même lorsqu'elles sont directement introduites dans la circulation sanguine. Les microbes à Gram négatif sont également soupçonnés de déployer des vésicules de la membrane externe bactérienne pour transloquer les protéines effectrices et les facteurs de virulence via une voie sécrétoire de trafic de vésicules membranaires, afin de modifier leur environnement ou d'attaquer/envahir les cellules cibles, par exemple à l'interface hôte-pathogène.
Évolution bactérienne/Évolution bactérienne :
L'évolution bactérienne peut faire référence à l'évolution biologique des bactéries telle qu'étudiée dans: Taxonomie bactérienne Liste des genres de bactéries Liste des ordres bactériens Liste des genres d'Archaea Liste des noms procaryotes avec statut dans la nomenclature Phylodynamique bactérienne Phylums bactériens Ordre de ramification des phylums bactériens (Woese, 1987) Ordre de ramification des phylums bactériens (Gupta, 2001) Ordre de ramification des phylums bactériens (Cavalier-Smith, 2002) Ordre de ramification des phylums bactériens (Rappe et Giovanoni, 2003) Ordre de ramification des phylums bactériens (Ciccarelli et al., 2006) Ordre de ramification des phylums bactériens (Battistuzzi et al., 2004) Projet 'The All-Species Living Tree' Ordre de ramification des phylums bactériens (Genome Taxonomy Database, 2018)
Efficacité de filtration bactérienne/Efficacité de filtration bactérienne :
L'efficacité de filtration bactérienne ou BFE est une mesure de la résistance d'un matériau respiratoire à la pénétration des bactéries. Les résultats sont rapportés en pourcentage d'efficacité et sont en corrélation avec la capacité du tissu à résister à la pénétration bactérienne. Des nombres plus élevés dans ce test indiquent une meilleure efficacité de la barrière. Les tissus d'emballage ont été comparés en fonction de la qualité ainsi que du grammage.
Tache bactérienne du fruit/Tache bactérienne du fruit :
La tache bactérienne des fruits (BFB) affecte les plantes de cucurbitacées dans le monde entier et peut constituer une menace sérieuse pour les agriculteurs car elle se propage par des semences contaminées. Le BFB est le résultat d'une infection par la bactérie Gram-négative Acidovorax citrulli, qui n'a été étudiée en détail que récemment. Les membres d'A. citrulli sont des bactéries Gram-négatives en forme de bâtonnet de dimensions 0,5 × 1,7 μm. Ils se déplacent via des flagelles polaires. Aucune source fiable connue de résistance au BFB n'existe aujourd'hui, donc l'hygiène des semences et des tests approfondis des installations d'élevage sont le meilleur moyen de contrôler la propagation. Cependant, aucune méthode de contrôle connue n'est extrêmement fiable pour réduire l'infection par le BFB.
Génétique bactérienne/Génétique bactérienne :
La génétique bactérienne est le sous-domaine de la génétique consacré à l'étude des bactéries. La génétique bactérienne est subtilement différente de la génétique eucaryote, mais les bactéries servent toujours de bon modèle pour les études génétiques animales. L'une des principales distinctions entre la génétique bactérienne et eucaryote provient du manque d'organites liés à la membrane des bactéries (ceci est vrai de tous les procaryotes. S'il est un fait qu'il existe des organites procaryotes, ils ne sont jamais liés par une membrane lipidique, mais par une coque de protéines), nécessitant la synthèse de protéines se produisent dans le cytoplasme. Comme d'autres organismes, les bactéries se reproduisent également fidèlement et conservent leurs caractéristiques de génération en génération, tout en présentant des variations de propriétés particulières dans une petite proportion de leur progéniture. Bien que l'héritabilité et les variations des bactéries aient été remarquées dès les premiers jours de la bactériologie, on ne s'était pas rendu compte alors que les bactéries obéissaient elles aussi aux lois de la génétique. Même l'existence d'un noyau bactérien était un sujet de controverse. Les différences de morphologie et d'autres propriétés ont été attribuées par Nageli en 1877 au pléomorphisme bactérien , qui postulait l'existence d'une seule, quelques espèces de bactéries, qui possédaient une capacité protéique de variation. Avec le développement et l'application de méthodes précises de culture pure, il est devenu évident que différents types de bactéries conservaient une forme et une fonction constantes à travers les générations successives. Cela a conduit au concept de monomorphisme.
Génome bactérien/Génome bactérien :
Les génomes bactériens sont généralement plus petits et moins variables en taille parmi les espèces par rapport aux génomes des eucaryotes. Les génomes bactériens peuvent varier en taille d'environ 130 kbp à plus de 14 Mbp. Une étude qui comprenait, mais sans s'y limiter, 478 génomes bactériens, a conclu qu'à mesure que la taille du génome augmente, le nombre de gènes augmente à un rythme disproportionnellement plus lent chez les eucaryotes que chez les non-eucaryotes. Ainsi, la proportion d'ADN non codant augmente avec la taille du génome plus rapidement chez les non-bactéries que chez les bactéries. Ceci est cohérent avec le fait que la plupart des ADN nucléaires eucaryotes ne codent pas pour les gènes, tandis que la majorité des gènes procaryotes, viraux et organites codent. À l'heure actuelle, nous avons des séquences de génomes de 50 phylums bactériens différents et de 11 phylums archéens différents. Le séquençage de deuxième génération a produit de nombreux brouillons de génomes (près de 90 % des génomes bactériens de GenBank ne sont actuellement pas complets) ; le séquençage de troisième génération pourrait éventuellement produire un génome complet en quelques heures. Les séquences du génome révèlent une grande diversité chez les bactéries. L'analyse de plus de 2 000 génomes d'Escherichia coli révèle un génome central d'E. coli d'environ 3 100 familles de gènes et un total d'environ 89 000 familles de gènes différentes. Les séquences du génome montrent que les bactéries parasites ont 500 à 1 200 gènes, les bactéries libres ont 1 500 à 7 500 gènes et les archées ont 1 500 à 2 700 gènes. Une découverte frappante de Cole et al. décrit des quantités massives de désintégration génétique en comparant le bacille de la lèpre aux bactéries ancestrales. Des études ont depuis montré que plusieurs bactéries ont des tailles de génome plus petites que leurs ancêtres. Au fil des ans, les chercheurs ont proposé plusieurs théories pour expliquer la tendance générale de la décomposition du génome bactérien et la taille relativement petite des génomes bactériens. Des preuves irréfutables indiquent que la dégradation apparente des génomes bactériens est due à un biais de suppression.
Glutathion_transférase bactérienne/Glutathion transférase bactérienne :
Les glutathion transférases bactériennes (GST; EC 2.5.1.18) font partie d'une superfamille d'enzymes qui jouent un rôle crucial dans la détoxification cellulaire. Le rôle principal des GST est de catalyser la conjugaison du glutathion (GSH) avec les centres électrophiles d'une grande variété de molécules. Les substrats les plus connus des GST sont les produits chimiques synthétiques xénobiotiques. Il existe également des classes de GST qui utilisent le glutathion comme cofacteur plutôt que comme substrat. Souvent, ces GST sont impliquées dans la réduction des espèces oxydantes réactives toxiques pour la bactérie. La conjugaison avec les récepteurs du glutathion rend les substances toxiques plus solubles et donc plus facilement exocytosées de la cellule.
Croissance bactérienne/Croissance bactérienne :
La croissance bactérienne est la prolifération d'une bactérie en deux cellules filles, dans un processus appelé fission binaire. À condition qu'aucun événement ne se produise, les cellules filles résultantes sont génétiquement identiques à la cellule d'origine. Par conséquent, la croissance bactérienne se produit. Les deux cellules filles de la division ne survivent pas nécessairement. Cependant, si le nombre de survivants dépasse l'unité en moyenne, la population bactérienne subit une croissance exponentielle. La mesure d'une courbe de croissance bactérienne exponentielle en culture discontinue faisait traditionnellement partie de la formation de tous les microbiologistes ; le moyen de base nécessite un dénombrement bactérien (comptage cellulaire) direct et individuel (microscopique, cytométrie en flux), direct et en masse (biomasse), indirect et individuel (comptage des colonies), ou indirect et en masse (nombre le plus probable, turbidité, absorption de nutriments) méthodes. Les modèles réconcilient la théorie avec les mesures.
Protéines bactériennes de nucléation de la glace/Protéines bactériennes de nucléation de la glace :
Les protéines bactériennes de nucléation de la glace sont une famille de protéines qui permettent aux bactéries Gram-négatives de favoriser la nucléation de la glace à des températures relativement élevées (supérieures à -5°C). Ces protéines sont localisées à la surface de la membrane externe et peuvent causer des dégâts de gel à de nombreuses plantes. La structure primaire des protéines contient un domaine hautement répétitif qui domine la séquence. Le domaine comprend un nombre de répétitions de 48 résidus, qui contiennent elles-mêmes 3 blocs de 16 résidus dont les 8 premiers sont identiques. On pense que le domaine répétitif peut être responsable de l'alignement des molécules d'eau dans le germe cristallin. [.........48.résidus.répétés.domaine..........] / / | | \ \ AGYGSTxTagxxssli AGYGSTxTagxxsxlt AGYGSTxTaqxxsxlt [16.résidus...] [16.résidus...] [16.résidus...]
Facteur_d'initiation bactérienne/Facteur d'initiation bactérienne :
Toutes les bactéries nécessitent l'utilisation de trois facteurs d'initiation : IF1 et IF2, pour la traduction. Certains embranchements nécessitent un IF3 supplémentaire.
Facteur_d'initiation bactérienne_1/Facteur d'initiation bactérienne 1 :
Le facteur d'initiation bactérienne 1 est un facteur d'initiation bactérienne. IF1 s'associe à la sous-unité ribosomale 30S dans le site A et empêche l'entrée d'un aminoacyl-ARNt. Il module la liaison d'IF2 au ribosome en augmentant son affinité. Cela peut également empêcher la sous-unité 50S de se lier, arrêtant la formation de la sous-unité 70S. Il contient également un repliement du domaine β commun aux protéines de liaison aux acides nucléiques. IF1 – IF3 peut également effectuer le recyclage des ribosomes.
Facteur_d'initiation bactérienne_2/Facteur d'initiation bactérienne 2 :
Le facteur d'initiation bactérienne-2 est un facteur d'initiation bactérienne. IF2 se lie à un ARNt initiateur et contrôle l'entrée de l'ARNt sur le ribosome. IF2, lié au GTP, se lie au site 30S P. Après association avec la sous-unité 30S, fMet-tRNAf se lie à l'IF2 puis IF2 transfère l'ARNt dans le site P partiel. Lorsque la sous-unité 50S se joint, elle hydrolyse le GTP en GDP et Pi, provoquant un changement conformationnel de l'IF2 qui provoque la libération d'IF2 et permet la formation du ribosome 70S. Les mitochondries humaines utilisent un homologue codé par le noyau, MTIF2, pour l'initiation de la traduction.
Rein_maladie bactérienne/Maladie rénale bactérienne :
La maladie rénale bactérienne (BKD, également connue sous le nom de maladie du furoncle blanc) est une infection systémique causée par la bactérie Renibacterium salmoninarum. La maladie affecte les populations de salmonidés sauvages. Le BKD a été découvert à l'origine dans les rivières écossaises Dee et Spey en 1933.
Pelouse bactérienne/pelouse bactérienne :
La pelouse bactérienne est un terme utilisé par les microbiologistes pour décrire l'apparence des colonies bactériennes lorsque toutes les colonies individuelles sur une plaque de gélose pour boîte de Pétri fusionnent pour former un champ ou un tapis de bactéries. Les pelouses bactériennes trouvent une utilisation dans les cribles pour la résistance aux antibiotiques et le titrage des bactériophages. Les pelouses bactériennes (souvent de Serratia marcescens ) sont également largement utilisées comme méthode de dosage lors de l'utilisation de bactériophages comme traceurs dans les études d'écoulement des eaux souterraines. Bien qu'il soit parfois utilisé comme synonyme de biofilm, le terme s'applique principalement aux tapis simples, clonaux et non structurés d'organismes qui ne se forment généralement que sur des milieux de croissance en laboratoire. Les biofilms - la forme agrégée de micro-organismes que l'on trouve le plus souvent dans la nature - sont généralement plus complexes et diversifiés et marqués par de plus grandes quantités de matrice structurelle extracellulaire par rapport à la biomasse cellulaire.
Brûlure bactérienne des feuilles/Brûlure bactérienne des feuilles :
La brûlure bactérienne des feuilles (communément abrégée BLS, également appelée tache foliaire bactérienne) est une maladie affectant de nombreuses cultures, causée principalement par la bactérie Xylella fastidiosa qui obstrue le xylème. Il peut être confondu avec la brûlure ordinaire des feuilles causée par des pratiques culturales telles que la surfertilisation.
Traînée de feuille bactérienne/Traînée de feuille bactérienne :
La raie bactérienne des feuilles (BLS), également connue sous le nom de paille noire, est une maladie bactérienne courante du blé. La maladie est causée par l'espèce bactérienne Xanthomonas translucens pv. onduleux. L'agent pathogène est présent dans le monde entier, mais constitue un problème majeur aux États-Unis dans le centre-sud inférieur et peut réduire les rendements jusqu'à 40 %.[6] Le BLS est principalement transmis par les semences (la maladie est transmise par les semences) et survit dans et sur les semences, mais peut également survivre dans les résidus de culture dans le sol en contre-saison. Pendant la saison de croissance, la bactérie peut se transférer d'une plante à l'autre par contact, mais elle se propage principalement par la pluie, le vent et le contact avec les insectes. La bactérie se développe dans des environnements humides et produit un exsudat bactérien crème à jaune qui, lorsqu'il est sec, apparaît de couleur claire et semblable à des écailles, ce qui entraîne une traînée sur les feuilles. L'invasion de l'épi de blé provoque des bandes de tissu nécrotique sur les arêtes, appelées Black Chaff.[14] La maladie n'est pas facile à gérer, car il n'y a pas de pesticides sur le marché pour le traitement de l'infection. Il existe quelques cultivars résistants, mais aucun traitement des semences n'existe. Certaines techniques de lutte antiparasitaire intégrée (IPM) peuvent être utilisées pour aider à prévenir l'infection, bien qu'aucune ne prévienne complètement la maladie.[2]
Leucyl_aminopeptidase bactérienne/Leucyl aminopeptidase bactérienne :
La leucyl aminopeptidase bactérienne (EC 3.4.11.10, Aeromonas proteolytica aminopeptidase) est une enzyme. Cette enzyme catalyse la réaction chimique suivante Libération d'un acide aminé N-terminal, préférentiellement la leucine, mais pas les acides glutamique ou aspartiqueC'est une enzyme zinc.
Microcompartiment bactérien/Microcompartiment bactérien :
Les microcompartiments bactériens (BMC) sont des structures semblables à des organites que l'on trouve dans les bactéries. Ils consistent en une enveloppe protéique qui renferme des enzymes et d'autres protéines. Les BMC ont généralement un diamètre d'environ 40 à 200 nanomètres et sont entièrement constitués de protéines. La coquille fonctionne comme une membrane, car elle est sélectivement perméable. D'autres compartiments à base de protéines trouvés dans les bactéries et les archées comprennent les nanocompartiments d'encapsuline et les vésicules de gaz.
Plasticité_morphologique_bactérienne / Plasticité morphologique bactérienne :
La plasticité morphologique bactérienne fait référence aux changements de forme et de taille que subissent les cellules bactériennes lorsqu'elles rencontrent des environnements stressants. Bien que les bactéries aient développé des stratégies moléculaires complexes pour maintenir leur forme, beaucoup sont capables de modifier leur forme en tant que stratégie de survie en réponse aux prédateurs protistes, aux antibiotiques, à la réponse immunitaire et à d'autres menaces.
Motilité bactérienne/Motilité bactérienne :
La motilité bactérienne est la capacité des bactéries à se déplacer indépendamment en utilisant l'énergie métabolique. La plupart des mécanismes de motilité qui ont évolué chez les bactéries ont également évolué en parallèle chez les archées. La plupart des bactéries en forme de bâtonnets peuvent se déplacer en utilisant leur propre pouvoir, ce qui permet la colonisation de nouveaux environnements et la découverte de nouvelles ressources pour leur survie. Le mouvement bactérien dépend non seulement des caractéristiques du milieu, mais aussi de l'utilisation de différents appendices pour se propulser. Les mouvements d'essaimage et de nage sont tous deux alimentés par des flagelles en rotation. Alors que l'essaimage est un mouvement 2D multicellulaire sur une surface et nécessite la présence de surfactants, la nage est un mouvement de cellules individuelles dans des environnements liquides. D'autres types de mouvement se produisant sur des surfaces solides comprennent les secousses, le glissement et le glissement, qui sont tous indépendants des flagelles. Les secousses dépendent de l'extension, de l'attachement à une surface et de la rétraction des pili de type IV qui tirent la cellule vers l'avant d'une manière similaire à l'action d'un grappin, fournissant de l'énergie pour faire avancer la cellule. Le vol à voile utilise différents complexes moteurs, tels que les complexes d'adhérence focale de Myxococcus. Contrairement aux motilités de contraction et de glissement, qui sont des mouvements actifs où la force motrice est générée par la cellule individuelle, le glissement est un mouvement passif. Il s'appuie sur la force motrice générée par la communauté cellulaire en raison des forces d'expansion causées par la croissance cellulaire au sein de la colonie en présence de surfactants, qui réduisent la friction entre les cellules et la surface. Le mouvement global d'une bactérie peut être le résultat d'une alternance de phases de culbute et de nage. En conséquence, la trajectoire d'une bactérie nageant dans un environnement uniforme formera une marche aléatoire avec des nages relativement droites interrompues par des culbutes aléatoires qui réorientent la bactérie. Les bactéries peuvent également présenter des taxis, c'est-à-dire la capacité de se déplacer vers ou de s'éloigner des stimuli de leur environnement. Dans la chimiotaxie, le mouvement global des bactéries répond à la présence de gradients chimiques. Dans la phototaxie, les bactéries peuvent se déplacer vers ou s'éloigner de la lumière. Cela peut être particulièrement utile pour les cyanobactéries, qui utilisent la lumière pour la photosynthèse. De même, les bactéries magnétotactiques alignent leur mouvement sur le champ magnétique terrestre. Certaines bactéries ont des réactions d'échappement leur permettant de s'éloigner des stimuli qui pourraient nuire ou tuer. Ceci est fondamentalement différent de la navigation ou de l'exploration, car les temps de réponse doivent être rapides. Les réactions d'échappement sont obtenues par des phénomènes de type potentiel d'action et ont été observées dans les biofilms ainsi que dans des cellules individuelles telles que les bactéries du câble. Actuellement, il existe un intérêt pour le développement de micronageurs biohybrides, des nageurs microscopiques qui sont en partie biologiques et en partie conçus par l'homme, tels que des bactéries nageuses modifiées pour transporter des marchandises.
Bacterial murein_precursor_exporter/Exportateur de précurseurs de mureine bactérienne :
La famille des exportateurs de précurseurs de muréines bactériennes (MPE) (TC # 2.A.103) est un membre de la superfamille des facilitateurs de diffusion de cations (CDF) des transporteurs membranaires. Les membres de la famille MPE se trouvent dans une grande variété de bactéries Gram-négatives et Gram-positives et facilitent la translocation des précurseurs de la muréine liée aux lipides (alias peptidoglycane). Une liste représentative des protéines appartenant à la famille MPE peut être trouvée dans la base de données de classification des transporteurs.
Nanofils bactériens/Nanofils bactériens :
Les nanofils bactériens (également connus sous le nom de nanofils microbiens) sont des appendices électriquement conducteurs produits par un certain nombre de bactéries, notamment (mais pas exclusivement) les genres Geobacter et Shewanella. Des nanofils conducteurs ont également été confirmés dans la cyanobactérie oxygénée Synechocystis PCC6803 et une coculture thermophile et méthanogène composée de Pelotomaculum thermopropionicum et de Methanothermobacter thermoautotrophicus. Du point de vue physiologique et fonctionnel, les nanofils bactériens sont divers. Le rôle précis que jouent les nanofils microbiens dans leurs systèmes biologiques n'a pas été pleinement réalisé, mais plusieurs fonctions proposées existent. En dehors d'un environnement naturel, les nanofils bactériens ont montré un potentiel d'utilité dans plusieurs domaines, notamment les industries de la bioénergie et de la bioremédiation.
Neuraminidase bactérienne/Neuraminidase bactérienne :
La neuraminidase bactérienne est un type de neuraminidase et un facteur de virulence pour de nombreuses bactéries, notamment Bacteroides fragilis et Pseudomonas aeruginosa. Sa fonction est de cliver un résidu d'acide sialique du ganglioside-GM1 (un modulateur de la surface cellulaire et de l'activité des récepteurs) en le transformant en asialo-GM1 auquel les pili de type 4 (facteurs d'attachement) se lient préférentiellement.
Système bactérien mono-hybride/Système bactérien mono-hybride :
Le système bactérien à un hybride (B1H) est une méthode d'identification du site cible spécifique à la séquence d'un domaine de liaison à l'ADN. Dans ce système, un facteur de transcription (TF) donné est exprimé sous la forme d'une fusion avec une sous-unité de l'ARN polymérase. En parallèle, une bibliothèque d'oligonucléotides randomisés représentant des séquences cibles potentielles de TF est clonée dans un vecteur séparé contenant les gènes sélectionnables HIS3 et URA3. Si le domaine de liaison à l'ADN (appât) se lie à un site cible potentiel d'ADN (proie) in vivo, il recrutera l'ARN polymérase vers le promoteur et activera la transcription des gènes rapporteurs dans ce clone. Les deux gènes rapporteurs, HIS3 et URA3, permettent respectivement des sélections positives et négatives. À la fin du processus, les clones positifs sont séquencés et examinés avec des outils de recherche de motifs afin de résoudre la séquence cible d'ADN privilégiée.
Membrane_externe bactérienne/Membrane externe bactérienne :
La membrane externe bactérienne se trouve dans les bactéries gram-négatives. Sa composition est distincte de celle de la membrane cellulaire cytoplasmique interne - entre autres, le feuillet externe de la membrane externe de nombreuses bactéries gram-négatives comprend un lipopolysaccharide complexe dont la partie lipidique agit comme une endotoxine - et chez certaines bactéries comme E. coli, il est lié au peptidoglycane de la cellule par la lipoprotéine de Braun. Des porines peuvent être trouvées dans cette couche.
Vesicules_de_membrane_externe bactériennes/Vésicules de la membrane externe bactérienne :
Les vésicules bactériennes de la membrane externe (OMV) sont des vésicules de lipides libérées par les membranes externes des bactéries Gram-négatives. Ces vésicules ont été les premières vésicules membranaires bactériennes (MV) à être découvertes, tandis que les bactéries Gram-positives libèrent également des vésicules. Les vésicules de la membrane externe ont été découvertes et caractérisées pour la première fois à l'aide de la microscopie électronique à transmission par le scientifique indien Prof. Smriti Narayan Chatterjee et J. Das en 1966-67. Les OMV se voient attribuer la fonctionnalité de fournir un moyen de communiquer entre eux, avec d'autres micro-organismes dans leur environnement et avec l'hôte. Ces vésicules sont impliquées dans le trafic de substances biochimiques de signalisation des cellules bactériennes, qui peuvent inclure de l'ADN, de l'ARN, des protéines, des endotoxines et des molécules de virulence apparentées. Cette communication se produit dans les cultures microbiennes dans les océans, à l'intérieur des animaux, des plantes et même à l'intérieur du corps humain. Les bactéries Gram-négatives déploient leur périplasme pour sécréter des OMV pour le trafic de produits biochimiques bactériens vers les cellules cibles dans leur environnement. Les OMV portent également un lipopolysaccharide endotoxique initiant un processus pathologique chez leur hôte. Ce mécanisme confère une variété d'avantages tels que la livraison à longue distance de cargaison sécrétoire bactérienne avec une dégradation hydrolytique et une dilution extracellulaire minimisées, également complétées par d'autres molécules de soutien (par exemple, des facteurs de virulence) pour accomplir un travail spécifique et pourtant, en gardant un coffre-fort -distance de l'arsenal de défense des cellules ciblées. Les signaux biochimiques trafiqués par les OMV peuvent varier considérablement pendant les situations de «guerre et de paix». Dans les colonies bactériennes " complaisantes ", les OMV peuvent être utilisés pour transporter l'ADN vers des microbes " apparentés " pour des transformations génétiques, et également transloquer des molécules de signalisation cellulaire pour la détection du quorum et la formation de biofilms. Lors du « défi » d'autres types de cellules, les OMV peuvent être préférés pour transporter des enzymes de dégradation et de subversion. De même, les OMV peuvent contenir davantage de protéines d'invasion à l'interface hôte-pathogène (Fig. 1). On s'attend à ce que les facteurs environnementaux autour des microbes sécrétoires soient responsables de l'induction de ces bactéries à synthétiser et à sécréter des OMV spécifiquement enrichis, physiologiquement adaptés à la tâche immédiate. Ainsi, les OMV bactériens, étant de puissants immunomodulateurs, peuvent être manipulés pour leur contenu immunogène et utilisés comme vaccins puissants sans agents pathogènes pour immuniser les humains et les animaux contre les infections menaçantes.
Oxydation bactérienne/Oxydation bactérienne :
La biooxydation des bactéries est un processus d'oxydation causé par des microbes où le métal précieux reste (mais s'enrichit) dans la phase solide. Dans ce processus, le métal reste dans la phase solide et le liquide peut être jeté. L'oxydation bactérienne est un processus biohydrométallurgique développé pour le traitement de pré-cyanuration des minerais ou concentrés d'or réfractaires. La culture bactérienne est une culture mixte d'Acidithiobacillus ferrooxidans, d'Acidithiobacillus thiooxidans et de Leptospirillum ferrooxidans. Le procédé d'oxydation bactérienne comprend la mise en contact d'un minerai ou d'un concentré de ROM de sulfure réfractaire avec une souche de la culture bactérienne pendant une période de traitement appropriée dans un environnement de fonctionnement optimal. Les bactéries oxydent les minéraux sulfurés, libérant ainsi l'or occlus pour une récupération ultérieure par cyanuration. Le procédé BIOX® est une technologie exclusive détenue par Biomin Afrique du Sud et utilisée sous licence par un certain nombre de mines en exploitation. Le procédé BIOX® implique une oxydation bactérienne dans des réservoirs agités pour le prétraitement des minerais réfractaires et des concentrés avant la lixiviation conventionnelle au cyanure pour la récupération de l'or. Dans des conditions végétales continues contrôlées, le nombre de cellules bactériennes et leur activité sont optimisés pour atteindre le taux le plus élevé d'oxydation des sulfures. Les bactéries ont besoin d'un environnement très acide (pH 1,0 à 4,0), d'une température comprise entre 30 et 45 °C et d'un apport constant d'oxygène et de dioxyde de carbone pour une croissance et une activité optimales. Les conditions de fonctionnement inhabituelles pour les bactéries ne sont pas favorables à la croissance de la plupart des autres microbes, éliminant ainsi le besoin de stérilité pendant le processus d'oxydation bactérienne. Parce que les substances organiques sont toxiques pour les bactéries, elles sont non pathogènes et incapables de provoquer des maladies. Les bactéries utilisées dans le processus ne présentent donc aucun risque pour la santé des humains ou des animaux. L'oxydation bactérienne des minéraux sulfurés de fer produit du sulfate de fer (III) et de l'acide sulfurique, et dans le cas de l'arsénopyrite, de l'acide arsenique est également produit. L'arsenic est éliminé de la liqueur par coprécipitation avec le fer et le sulfate dans un processus de neutralisation en deux étapes. Cela produit un précipité de neutralisation solide contenant en grande partie du sulfate de calcium, de l'arséniate de fer (III) basique et de l'hydroxyde de fer (III). L'arséniate de fer(III) est suffisamment insoluble et stable pour permettre d'éliminer en toute sécurité le produit de neutralisation sur une digue à boues. La liqueur de neutralisation, purifiée pour contenir un taux acceptable d'arsenic, peut être réutilisée dans les circuits de broyage, de flottation ou d'oxydation bactérienne.
Motifs bactériens/Modèles bactériens :
La formation de modèles dans la croissance des colonies bactériennes a été largement étudiée expérimentalement. Les morphologies résultantes semblent dépendre des conditions de croissance. Ils incluent des morphologies bien connues telles que la morphologie ramifiée dense (DBM) ou l'agrégation limitée par la diffusion (DLA), mais des modèles et des comportements temporels beaucoup plus complexes peuvent être trouvés. Un grand nombre d'études sur la formation de motifs dans les colonies bactériennes ont été réalisées chez Bacillus subtilis et chez Proteus mirabilis. La modélisation mathématique de la croissance des colonies permet de reproduire les morphologies observées et l'effet des changements environnementaux. Les modèles employés incluent : Système de réaction-diffusion Automates cellulaires
Embranchements bactériens/Embranchements bactériens :
Les embranchements bactériens constituent les lignées majeures du domaine Bactéries. Alors que la définition exacte d'un phylum bactérien est débattue, une définition populaire est qu'un phylum bactérien est une lignée monophylétique de bactéries dont les gènes d'ARNr 16S partagent une identité de séquence par paires d'environ 75% ou moins avec ceux des membres d'autres phylums bactériens. Il a été estimé qu'il existe environ 1 300 embranchements bactériens. En mai 2020, 41 phylums bactériens sont formellement acceptés par le LPSN, 89 phylums bactériens sont reconnus dans la base de données Silva, des dizaines d'autres ont été proposés et des centaines restent probablement à découvrir. En 2017, environ 72 % des embranchements bactériens largement reconnus étaient des embranchements candidats (c'est-à-dire qu'ils n'ont pas de représentants cultivés). Il n'y a pas de règles fixes pour la nomenclature des embranchements bactériens. Il a été proposé que le suffixe "-bacteria" soit utilisé pour les phylums.
Phylodynamique bactérienne / Phylodynamique bactérienne :
La phylodynamique bactérienne est l'étude de l'immunologie, de l'épidémiologie et de la phylogénétique des pathogènes bactériens pour mieux comprendre le rôle évolutif de ces pathogènes. L'analyse phylodynamique comprend l'analyse de la diversité génétique, de la sélection naturelle et de la dynamique des populations des phylogénies des agents pathogènes des maladies infectieuses pendant les pandémies et l'étude de l'évolution intra-hôte des virus. La phylodynamique combine l'étude de l'analyse phylogénétique, des processus écologiques et évolutifs pour mieux comprendre les mécanismes qui régissent l'incidence spatiotemporelle et les schémas phylogénétiques des pathogènes bactériens. La phylodynamique bactérienne utilise des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) à l'échelle du génome afin de mieux comprendre le mécanisme évolutif des pathogènes bactériens. De nombreuses études phylodynamiques ont été réalisées sur des virus, en particulier des virus à ARN (voir Phylodynamique virale) qui ont des taux de mutation élevés. Le domaine de la phylodynamique bactérienne a considérablement augmenté en raison de l'avancement du séquençage de nouvelle génération et de la quantité de données disponibles.
Pneumonie bactérienne/Pneumonie bactérienne :
La pneumonie bactérienne est un type de pneumonie causée par une infection bactérienne.
Transporteur bactérien du potassium/Transporteur bactérien du potassium :
Cette famille de protéines est constituée de diverses protéines de transport du potassium (Trk) et de la sous-unité J de l'ATP synthase sodique de type V ou translocation ATPase J (EC). Ces protéines sont impliquées dans l'absorption active de sodium en utilisant l'ATP dans le processus. TrkH d'Escherichia coli est une protéine transmembranaire et détermine la spécificité et la cinétique du transport des cations par le système TrK dans cet organisme. Cette protéine interagit avec TrkA et nécessite TrkE pour l'activité de transport.
Recombinaison bactérienne/Recombinaison bactérienne :
La recombinaison bactérienne est un type de recombinaison génétique chez les bactéries caractérisée par le transfert d'ADN d'un organisme appelé donneur à un autre organisme receveur. Ce processus se produit de trois manières principales : Transformation, l'absorption d'ADN exogène du milieu environnant. Transduction, transfert d'ADN entre bactéries par l'intermédiaire d'un virus. Conjugaison, le transfert d'ADN d'une bactérie à une autre par contact de cellule à cellule. Le résultat final de la conjugaison, de la transduction et/ou de la transformation est la production de recombinants génétiques, des individus qui portent non seulement les gènes qu'ils ont hérités de leur parent les cellules mais aussi les gènes introduits dans leurs génomes par conjugaison, transduction et/ou transformation. La recombinaison chez les bactéries est habituellement catalysée par une recombinase de type RecA. Ces recombinases favorisent la réparation des dommages à l'ADN par recombinaison homologue. La capacité de subir une transformation naturelle est présente chez au moins 67 espèces bactériennes. La transformation naturelle est courante chez les espèces bactériennes pathogènes. Dans certains cas, la capacité de réparation de l'ADN fournie par la recombinaison lors de la transformation facilite la survie de l'agent pathogène bactérien infectant. La transformation bactérienne est réalisée par de nombreux produits de gènes bactériens en interaction.
Rhodopsine bactérienne/Rhodopsine bactérienne :
La rhodopsine bactérienne peut désigner : la rhodopsine microbienne, également connue sous le nom de rhodopsine de type I, la bactériorhodopsine, un type de rhodopsine microbienne.
Système_de_sécrétion_bactérienne/Système de sécrétion bactérienne :
Les systèmes de sécrétion bactériens sont des complexes protéiques présents sur les membranes cellulaires des bactéries pour la sécrétion de substances. Plus précisément, ce sont les dispositifs cellulaires utilisés par les bactéries pathogènes pour sécréter leurs facteurs de virulence (principalement des protéines) afin d'envahir les cellules hôtes. Ils peuvent être classés en différents types en fonction de leur structure, composition et activité spécifiques. Généralement, les protéines peuvent être sécrétées par deux processus différents. Un processus est un mécanisme en une étape dans lequel les protéines du cytoplasme des bactéries sont transportées et délivrées directement à travers la membrane cellulaire dans la cellule hôte. Une autre implique une activité en deux étapes dans laquelle les protéines sont d'abord transportées hors de la membrane cellulaire interne, puis déposées dans le périplasme, et enfin à travers la membrane cellulaire externe dans la cellule hôte. Ces différences majeures peuvent être distinguées entre Gram-négatif ( diderm) et les bactéries Gram-positives (monoderm). Mais la classification n'est en aucun cas claire et complète. Il existe au moins huit types spécifiques aux bactéries Gram-négatives, quatre aux bactéries Gram-positives, tandis que deux sont communes aux deux. De plus, il existe une différence notable entre les bactéries didermiques à lipopolysaccharide sur la membrane externe (diderm-LPS) et celles à acide mycolique (diderm-mycolate).
Sénescence bactérienne/Sénescence bactérienne :
La sénescence bactérienne ou le vieillissement bactérien fait référence à la diminution progressive de la fonction cellulaire chez les bactéries individuelles à mesure qu'elles vieillissent. Les indicateurs de sénescence comprennent un taux de division ralenti et une probabilité accrue de décès. On pense que la cause fondamentale du vieillissement des bactéries est l'accumulation de composants délétères (facteurs de vieillissement). Les bactéries à division asymétrique, telles que Caulobacter crescentus, montrent des signes de vieillissement réplicatif. Les résultats pour les bactéries à division symétrique sont plus nuancés. Par exemple, Escherichia coli, dans certaines conditions expérimentales, peut présenter des signes de vieillissement réplicatif causés par de subtiles asymétries dans sa division.
Petit_ARN bactérien/Petit ARN bactérien :
Les petits ARN bactériens (ARNs) sont de petits ARN produits par des bactéries ; ce sont des molécules d'ARN non codantes de 50 à 500 nucléotides, hautement structurées et contenant plusieurs tiges-boucles. De nombreux ARNs ont été identifiés à l'aide d'analyses informatiques et de techniques de laboratoire telles que le Northern blot, les puces à ADN et l'ARN-Seq dans un certain nombre d'espèces bactériennes, notamment Escherichia coli, l'agent pathogène modèle Salmonella, l'alphaprotéobactérie fixatrice d'azote Sinorhizobium meliloti, les cyanobactéries marines, Francisella tularensis (l'agent causal de la tularémie), Streptococcus pyogenes, l'agent pathogène Staphylococcus aureus et l'agent pathogène des plantes Xanthomonas oryzae pathovar oryzae. Les ARNs bactériens affectent la façon dont les gènes sont exprimés dans les cellules bactériennes via l'interaction avec l'ARNm ou les protéines, et peuvent donc affecter diverses fonctions bactériennes telles que le métabolisme, la virulence, la réponse au stress environnemental et la structure.
Pourriture molle bactérienne/Pourriture molle bactérienne :
Les pourritures molles bactériennes sont causées par plusieurs types de bactéries, mais le plus souvent par des espèces de bactéries gram-négatives, Erwinia, Pectobacterium et Pseudomonas. C'est une maladie destructrice des fruits, des légumes et des plantes ornementales que l'on trouve dans le monde entier et qui affecte les genres de presque toutes les familles de plantes. Les bactéries attaquent principalement les organes de stockage charnus de leurs hôtes (tubercules, bulbes, bulbes et rhizomes), mais elles affectent également les bourgeons succulents, les tiges et les tissus des pétioles. À l'aide d'enzymes spéciales, la plante est transformée en une bouillie liquide afin que les bactéries consomment les nutriments de la cellule végétale. La propagation de la maladie peut être causée par une simple interaction physique entre les tissus infectés et sains pendant le stockage ou le transport. La maladie peut également être propagée par les insectes. Le contrôle de la maladie n'est pas toujours très efficace, mais des pratiques sanitaires dans la production, le stockage et la transformation sont quelque chose qui peut être fait afin de ralentir la propagation de la maladie et de protéger les rendements.
Réponse au stress bactérien/Réponse au stress bactérien :
La réponse bactérienne au stress permet aux bactéries de survivre à des conditions défavorables et fluctuantes dans leur environnement immédiat. Divers mécanismes bactériens reconnaissent différents changements environnementaux et élaborent une réponse appropriée. Une cellule bactérienne peut réagir simultanément à une grande variété de stress et les différents systèmes de réponse au stress interagissent les uns avec les autres par un complexe de réseaux de régulation mondiaux. Les bactéries peuvent survivre dans diverses conditions environnementales et afin de surmonter ces conditions défavorables et changeantes, les bactéries doivent détecter les changements et monter des réponses appropriées dans l'expression des gènes et l'activité des protéines. La réponse au stress chez les bactéries implique un réseau complexe d'éléments qui neutralise le stimulus externe. Les bactéries peuvent réagir simultanément à une variété de stress et les différents systèmes de réponse au stress interagissent (diaphonie) les uns avec les autres. Un réseau complexe de systèmes réglementaires mondiaux conduit à une réponse coordonnée et efficace. Ces systèmes de régulation régissent l'expression de plusieurs effecteurs qui maintiennent la stabilité de l'équilibre cellulaire dans les différentes conditions. Ces systèmes peuvent inclure des réponses immédiates telles que des chaperons, ainsi que des réponses plus lentes comme la régulation transcriptionnelle pour contrôler la production de protéines, la latence et autres. Les systèmes de réponse au stress peuvent jouer un rôle important dans la virulence des organismes pathogènes. Leurs systèmes de réponse au stress, tels que l'entrée dans un état latent, peuvent leur permettre de survivre aux conditions stressantes à l'intérieur de l'hôte ou d'un autre environnement. Il existe des systèmes de régulation qui réagissent aux changements de température, de pH, de nutriments, de sels et d'oxydation. Le niveau de réponse est basé sur la quantité de changement qui se produit dans l'environnement. La réponse est la plus élevée lorsque des changements se produisent dans des conditions de stress, dans ce cas, les réseaux de contrôle sont appelés systèmes de réponse au stress. Ces systèmes sont très similaires chez les procaryotes et certains de ces systèmes, en particulier la réponse au choc thermique, sont conservés chez les eucaryotes et les archées. Bien que les systèmes soient extrêmement similaires, les conditions dans lesquelles ils sont activés diffèrent considérablement d'un organisme à l'autre. Les systèmes qui activent la réponse aux changements environnementaux ont de nombreux éléments de contrôle. Ces éléments de contrôle peuvent être spécifiques à un gène ou ils peuvent contrôler un grand groupe de gènes. Lorsque des éléments de contrôle contrôlent un grand groupe de gènes, cela s'appelle un régulon. Un régulon est un groupe de gènes qui sont tous régulés par le même schéma de contrôle. Un stimulon est l'ensemble des gènes qui expriment des réponses à la même condition. Les éléments de contrôle régulent également l'expression des gènes dans diverses conditions environnementales, notamment la famine, la sporulation et autres.
Taxonomie bactérienne/Taxonomie bactérienne :
La taxonomie bactérienne est la taxonomie, c'est-à-dire la classification basée sur le rang, des bactéries. Dans la classification scientifique établie par Carl Linnaeus, chaque espèce doit être affectée à un genre (nomenclature binaire), qui est à son tour un niveau inférieur d'une hiérarchie de rangs (famille, sous-ordre, ordre, sous-classe, classe, division/phyla, royaume et domaine). Dans la classification actuellement acceptée de la vie, il existe trois domaines (Eucaryotes, Bactéries et Archaea), qui, en termes de taxonomie, bien qu'ils suivent les mêmes principes, ont plusieurs conventions différentes entre eux et entre leurs subdivisions car ils sont étudiés par différentes disciplines ( botanique, zoologie, mycologie et microbiologie). Par exemple, en zoologie, il existe des spécimens types, alors qu'en microbiologie, il existe des souches types.
Bactérithérapie/Bactérithérapie :
La bactérithérapie est l'utilisation thérapeutique de bactéries pour traiter des maladies. Les thérapeutiques bactériennes sont des médicaments vivants et peuvent être des bactéries de type sauvage (souvent sous la forme de probiotiques) ou des bactéries génétiquement modifiées pour posséder des propriétés thérapeutiques qui sont injectées à un patient. D'autres exemples de médicaments vivants comprennent la thérapeutique cellulaire (y compris l'immunothérapie) et la thérapeutique des phages.
Transcription bactérienne/transcription bactérienne :
La transcription bactérienne est le processus dans lequel un segment d'ADN bactérien est copié dans un brin nouvellement synthétisé d'ARN messager (ARNm) à l'aide de l'enzyme ARN polymérase. Le processus se déroule en trois étapes principales : initiation, allongement et terminaison ; et le résultat final est un brin d'ARNm qui est complémentaire d'un seul brin d'ADN. Généralement, la région transcrite représente plus d'un gène. En fait, de nombreux gènes procaryotes se trouvent dans les opérons, qui sont une série de gènes qui fonctionnent ensemble pour coder pour la même protéine ou le même produit génique et sont contrôlés par un seul promoteur. L'ARN polymérase bactérienne est composée de quatre sous-unités et lorsqu'une cinquième sous-unité se fixe, appelée facteur σ, la polymérase peut reconnaître des séquences de liaison spécifiques dans l'ADN, appelées promoteurs. La liaison du facteur σ au promoteur est la première étape de l'initiation. Une fois que le facteur σ est libéré de la polymérase, l'allongement se poursuit. La polymérase continue le long de l'ADN double brin, le déroule et synthétise le nouveau brin d'ARNm jusqu'à ce qu'il atteigne un site de terminaison. Il existe deux mécanismes de terminaison qui sont décrits plus en détail ci-dessous. La terminaison est nécessaire à des sites spécifiques pour que l'expression génique appropriée se produise. L'expression génique détermine la quantité de produits géniques, tels que les protéines, fabriqués par le gène. La transcription est effectuée par l'ARN polymérase mais sa spécificité est contrôlée par des protéines de liaison à l'ADN spécifiques à la séquence appelées facteurs de transcription. Les facteurs de transcription agissent pour reconnaître des séquences d'ADN spécifiques et, en fonction des besoins des cellules, favorisent ou inhibent une transcription supplémentaire. Semblable à d'autres taxons, les bactéries subissent des rafales de transcription : 125 Les travaux de l'équipe Jones dans Jones et al 2014 expliquent certaines des causes sous-jacentes des rafales et d'autres variabilités, y compris la stabilité de l'ARNm résultant : 125 la force de la promotion codée dans le promoteur pertinent et la durée de la transcription en raison de la force du site de liaison TF. Ils ont également constaté que les TF bactériens persistent trop brièvement pour que les caractéristiques de liaison des TF expliquent la transcription soutenue des rafales. La transcription bactérienne diffère de la transcription eucaryote de plusieurs manières. Chez les bactéries, la transcription et la traduction peuvent se produire simultanément dans le cytoplasme de la cellule, alors que chez les eucaryotes, la transcription se produit dans le noyau et la traduction se produit dans le cytoplasme. Il n'y a qu'un seul type d'ARN polymérase bactérienne alors que les eucaryotes en ont 3 types. Les bactéries ont un facteur σ qui détecte et se lie aux sites promoteurs, mais les eucaryotes n'ont pas besoin d'un facteur σ. Au lieu de cela, les eucaryotes ont des facteurs de transcription qui permettent la reconnaissance et la liaison des sites promoteurs. Dans l'ensemble, la transcription au sein des bactéries est un processus hautement régulé qui est contrôlé par l'intégration de nombreux signaux à un moment donné. Les bactéries dépendent fortement de la transcription et de la traduction pour générer des protéines qui les aident à répondre spécifiquement à leur environnement.
Traduction bactérienne/Traduction bactérienne :
La traduction bactérienne est le processus par lequel l'ARN messager est traduit en protéines dans les bactéries.
Vaginose bactérienne/Vagginose bactérienne :
La vaginose bactérienne (VB) est une maladie du vagin causée par une croissance excessive de bactéries. Les symptômes courants comprennent une augmentation des pertes vaginales qui sentent souvent le poisson. La décharge est généralement de couleur blanche ou grise. Des brûlures à la miction peuvent survenir. Les démangeaisons sont rares. Parfois, il peut n'y avoir aucun symptôme. Avoir BV double approximativement le risque d'infection par un certain nombre d'infections sexuellement transmissibles, y compris le VIH/SIDA. Il augmente également le risque d'accouchement précoce chez les femmes enceintes. La VB est causée par un déséquilibre des bactéries naturellement présentes dans le vagin. Il y a un changement dans le type de bactérie le plus courant et une augmentation de cent à mille fois du nombre total de bactéries présentes. En règle générale, les bactéries autres que les lactobacilles deviennent plus courantes. Les facteurs de risque comprennent les douches vaginales, les partenaires sexuels nouveaux ou multiples, les antibiotiques et l'utilisation d'un dispositif intra-utérin, entre autres. Cependant, il n'est pas considéré comme une infection sexuellement transmissible. Le diagnostic est suspecté sur la base des symptômes et peut être vérifié en testant les pertes vaginales et en trouvant un pH vaginal supérieur à la normale et un grand nombre de bactéries. La VB est souvent confondue avec une infection vaginale à levures ou une infection à Trichomonas. Habituellement, le traitement repose sur un antibiotique, tel que la clindamycine ou le métronidazole. Ces médicaments peuvent également être utilisés au cours du deuxième ou du troisième trimestre de la grossesse. Cependant, la condition se reproduit souvent après le traitement. Les probiotiques peuvent aider à prévenir la réapparition. On ne sait pas si l'utilisation de probiotiques ou d'antibiotiques affecte les résultats de la grossesse. La VB est l'infection vaginale la plus courante chez les femmes en âge de procréer. Le pourcentage de femmes touchées à un moment donné varie entre 5 % et 70 %. La VB est plus courante dans certaines régions d'Afrique et moins courante en Asie et en Europe. Aux États-Unis, environ 30 % des femmes âgées de 14 à 49 ans sont touchées. Les taux varient considérablement entre les groupes ethniques au sein d'un même pays. Alors que des symptômes de type VB ont été décrits pendant une grande partie de l'histoire enregistrée, le premier cas clairement documenté s'est produit en 1894.
Flétrissement bactérien/Flétrissement bactérien :
Le flétrissement bactérien est un ensemble de maladies qui surviennent chez les plantes telles que les cucurbitacées et les solanacées (tomate, haricot commun, etc.) et sont causées par les agents pathogènes Erwinia tracheiphila, une bactérie à Gram négatif, ou Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens, une bactérie gram-positive. Les plants de concombre et de melon brodé sont les plus sensibles, mais les courges, les citrouilles et les courges peuvent également être infectées.
Flétrissement bactérien_de_l'oeillet/Flétrissement bactérien de l'oeillet :
Le flétrissement bactérien des œillets est une maladie bactérienne causée par le phytopathogène Paraburkholderia caryophylli (souvent appelé Burkholderia caryophylli). Précédemment nommé Pseudomonas caryophilli, l'agent pathogène est une bactérie aérobie à Gram négatif connue pour n'être capable de pénétrer son hôte que par des blessures. Une fois à l'intérieur de l'hôte, il colonise le système vasculaire et les racines provoquant des symptômes tels que la fissuration interne de la tige, le jaunissement des feuilles, le flétrissement et le développement de chancres. En tant que maladie bactérienne, la flétrissure bactérienne des œillets peut également être caractérisée par des signes tels que le ruissellement bactérien et le suintement bactérien.
Flétrissement bactérien_du_gazon/Flétrissement bactérien du gazon :
Le flétrissement bactérien du gazon est la seule maladie bactérienne connue du gazon. L'agent causal est la bactérie Gram négatif Xanthomonas campestris pv. graminées. Le premier cas de flétrissement bactérien du gazon a été signalé chez un cultivar d'agrostide stolonifère connu sous le nom de Toronto ou C-15, que l'on trouve dans tout le Midwest des États-Unis. Jusqu'à ce que l'agent causal soit identifié en 1984, la maladie était simplement appelée déclin du C-15. Cette maladie se trouve presque exclusivement sur les greens des terrains de golf où une tonte extensive crée des blessures dans l'herbe que l'agent pathogène utilise pour pénétrer dans l'hôte et provoquer la maladie.
Bacteriastrum/Bacteriastrum :
Bacteriastrum est un genre de diatomées de la famille des Chaetocerotaceae. Il existe plus de 30 espèces décrites dans le genre Bacteriastrum, mais beaucoup d'entre elles ne sont pas actuellement acceptées et de nouvelles espèces sont encore ajoutées au genre. L'espèce type du genre est Bacteriastrum furcatum Shadbolt.
Bacteriastrum delicatulum/Bacteriastrum delicatulum :
Bacteriastrum delicatulum est une diatomée du genre Bacteriastrum.
Bactéricères / Bactéricères :
Bactericera est un genre de psylle de la famille des Triozidae.
Bactéricera albiventris/Bactericera albiventris :
Bactericera albiventris est une punaise hémiptère de la famille des Triozidae, qui provoque des galles sur les feuilles des saules (espèce Salix). Il a été décrit pour la première fois par Arnold Förster en 1848.
Bactéricera cockerelli/Bactericera cockerelli :
Bactericera cockerelli, également connu sous le nom de psylle de la pomme de terre, est une espèce de psylle originaire du sud de l'Amérique du Nord. Son aire de répartition s'étend du nord de l'Amérique centrale au nord-ouest du Pacifique américain et à certaines parties du Manitoba. Elle est limitée à la partie occidentale du continent. Comme son nom l'indique, on le trouve couramment sur les cultures de pommes de terre et de tomates, mais sa gamme d'espèces comprend plus de 40 espèces de plantes solanacées et jusqu'à 20 genres. Les hôtes reproducteurs sont généralement reconnus comme se limitant principalement aux solanacées, y compris d'importantes espèces de plantes cultivées et de mauvaises herbes communes, et à quelques espèces de convolvulacées, notamment le liseron des champs et la patate douce. Sur certaines plantes, en particulier la pomme de terre, l'alimentation des nymphes provoque une condition appelée jaunisse des psylles, présumée être le résultat d'une toxine. Les nymphes et les adultes peuvent transmettre la bactérie Candidatus Liberibacter. La puce zébrée est une maladie récemment diagnostiquée des pommes de terre associée à une infestation de psylles et causée par des espèces de la bactérie gram-négative, Candidatus Liberibacter. Les tubercules présentent fréquemment une décoloration qui devient plus claire lors de la friture des frites. Cette maladie occasionne des pertes très importantes aux agriculteurs lorsqu'elle survient car les pommes de terre ne sont pas adaptées à la fabrication de chips ou de frites. Le ravageur a causé des pertes importantes dans les rendements de pommes de terre pendant les périodes d'augmentation importante de la population. La perte maximale de rendement de la pomme de terre semble être liée aux infestations survenant au début de la saison de croissance ou sur les cultures ayant un couvert foliaire important en été. Les psylles ne tolèrent pas la chaleur et on pense qu'ils survivent aux températures estivales dans les cultures avec un couvert foliaire suffisant tout au long de l'été pour offrir de l'ombre. Les nymphes sont très petites et discrètes, se nourrissant de la face inférieure des feuilles. Les nymphes et les adultes se nourrissent dans le phloème. On pense depuis longtemps que ces psylles migrent chaque année des régions du sud de l'Amérique du Nord vers le nord, mais des preuves plus récentes indiquent que des populations distinctes existent au niveau régional.
Bactéricide/Bactéricide :
Un bactéricide ou bactéricide, parfois abrégé Bcide, est une substance qui tue les bactéries. Les bactéricides sont des désinfectants, des antiseptiques ou des antibiotiques. Cependant, les surfaces des matériaux peuvent également avoir des propriétés bactéricides basées uniquement sur leur structure de surface physique, comme par exemple les biomatériaux comme les ailes d'insectes.
Bactéridielle/Bactéridielle :
Bacteridiella est un genre de petits escargots de mer, mollusques gastéropodes marins de la famille des Pyramidellidae, les pyrams et leurs alliés.
Bactéridie/Bactéridie :
Bacteridium est un genre d'escargots de mer, mollusques gastéropodes marins de la famille des Pyramidellidae, les pyrams et leurs alliés.
Bactéridium bermudense/Bacteridium bermudense :
Bacteridium bermudense est une espèce d'escargot de mer, un mollusque gastéropode marin de la famille des Pyramidellidae, les pyrams et leurs alliés. L'espèce reste dans le genre Bacteridium des gastéropodes, à l'exception des trois autres espèces apparentées qui sont Bacteridium carinatum, Bacteridium reticulum et Bacteridium vittatum.
Bacteridium carinatum/Bacteridium carinatum :
Bacteridium carinatum est une espèce d'escargot de mer, un mollusque gastéropode marin de la famille des Pyramidellidae et du genre Bacteridium.
Bacteridium reticulum/Bacteridium reticulum :
Bacteridium resticulum est une espèce d'escargot de mer, un mollusque gastéropode marin de la famille des Pyramidellidae, les pyrams et leurs alliés. L'espèce reste dans le genre Bacteridium des gastéropodes, à l'exception des trois autres espèces apparentées étant Bacteridium bermudense, Bacteridium carinatum et Bacteridium vittatum.
Bacteridium vittatum/Bacteridium vittatum :
Bacteridium vittatum est une espèce d'escargot de mer, un mollusque gastéropode marin de la famille des Pyramidellidae, les pyrams et leurs alliés. L'espèce appartient au genre de gastéropodes Bacteridium, avec Bacteridium bermudense, Bacteridium carinatum et Bacteridium resticulum.
Bactériochlorophylle/Bactériochlorophylle :
Les bactériochlorophylles (BChl) sont des pigments photosynthétiques présents dans diverses bactéries phototrophes. Ils ont été découverts par CB van Niel en 1932. Ils sont liés aux chlorophylles, qui sont les principaux pigments des plantes, des algues et des cyanobactéries. Les organismes qui contiennent de la bactériochlorophylle effectuent la photosynthèse pour subvenir à leurs besoins énergétiques, mais ne produisent pas d'oxygène en tant que sous-produit. Ils utilisent des longueurs d'onde de lumière non absorbées par les plantes ou les cyanobactéries. Le remplacement de Mg2+ par des protons donne la bactériophéophytine (BPh), la forme phéophytine. Structures de certaines bactériochlorophylles
Bactériocine/Bactériocine :
Les bactériocines sont des toxines protéiques ou peptidiques produites par des bactéries pour inhiber la croissance de souches bactériennes similaires ou étroitement apparentées. Ils sont similaires aux facteurs de destruction de la levure et de la paramécie et sont structurellement, fonctionnellement et écologiquement divers. Les applications des bactériocines sont testées pour évaluer leur application en tant qu'antibiotiques à spectre étroit. Les bactériocines ont été découvertes pour la première fois par André Gratia en 1925. Il a été impliqué dans le processus de recherche de moyens de tuer les bactéries, ce qui a également abouti au développement d'antibiotiques et à la découverte du bactériophage, le tout en l'espace de quelques années. Il a appelé sa première découverte une colicine parce qu'elle a tué E. coli.
Bactériocine IId/Bactériocine IId :
La bactériocine AS-48 est un antibiotique peptidique cyclique produit par l'eubactérie Enterococcus faecalis (Streptococcus faecalis) qui présente un large spectre antimicrobien contre les bactéries Gram-positives et Gram-négatives. La bactériocine AS-48 est codée par le plasmide pMB2 sensible aux phéromones et agit sur la membrane plasmique dans laquelle elle ouvre des pores entraînant une fuite d'ions et la mort cellulaire. La structure globulaire de la bactériocine AS-48 est composée de cinq hélices alpha renfermant un noyau hydrophobe. La protéine effectrice NK-lysine de mammifère des cellules T et tueuses naturelles a une structure similaire, bien qu'elle n'ait pas d'homologie de séquence avec les bactériocines AS-48. La bactériocine utilise des composants du système mannose phosphotransférase (man-PTS) des cellules sensibles comme cible/récepteur. La protéine immunitaire LciA forme un complexe puissant avec les protéines réceptrices et la bactériocine, empêchant ainsi la destruction des cellules. Le complexe entre LciA et les composants man-PTS (IIAB, IIC et IID) semble impliquer un mécanisme de type marche-arrêt qui ne permet la formation de complexes qu'en présence de bactériocine; sinon, aucun complexe n'a été observé entre LciA et les protéines réceptrices.
Bactériocinogène/Bactériocinogène :
Les bactériocinogènes, également appelés plasmides bactériocinogènes, sont des plasmides bactériens qui dirigent la synthèse des bactériocines, des protéines bactéricides produites par certains types de bactéries qui tuent d'autres souches de la même espèce ou d'espèces étroitement apparentées. Normalement, le bactériocinogène est réprimé et n'exprime pas la bactériocine, mais dans certaines conditions, le plasmide est déréprimé de manière complexe et mal comprise.
Bactériocyte/Bactériocyte :
Un bactériocyte (grec pour cellule bactérienne), également appelé mycétocyte, est un adipocyte spécialisé que l'on trouve principalement dans certains groupes d'insectes tels que les pucerons, les mouches tsé-tsé, les blattes germaniques, les charançons. Ces cellules contiennent des organismes endosymbiotiques tels que des bactéries et des champignons, qui fournissent des acides aminés essentiels et d'autres produits chimiques à leur hôte. Les bactériocytes peuvent s'agréger dans un organe spécialisé appelé le bactériome. L'endosymbiose avec des micro-organismes est courante chez les insectes. Plus de 10 % des espèces d'insectes dépendent des bactéries intracellulaires pour leur développement et leur survie. Les endosymbiontes et leurs relations avec leurs hôtes sont divers à la fois fonctionnellement et génétiquement. Cependant, la cellule hôte dans laquelle résident les endosymbiontes bactériens et fongiques est pour la plupart inconnue.
Bactérioferritine/Bacterioferritine :
La bactérioferritine (Bfr) est une protéine oligomérique contenant à la fois un centre de fer binucléaire et de l'hème b. La structure tertiaire et quaternaire de Bfr est très similaire à celle de la ferritine. Les fonctions physiologiques du BFR, qui peuvent être autres que la simple absorption de fer, ne sont pas claires. Bfr forme une coquille creuse à peu près sphérique à partir de 24 sous-unités identiques, incorporant 12 groupes hèmes. Le fer est stocké sous forme de minéral d'oxyde ferrique hydraté dans sa cavité centrale (environ 80 Å de diamètre). Le complexe global a une symétrie cubique (432). Chaque sous-unité comprend un site binucléaire de liaison au métal (le site diiron) reliant les quatre hélices principales de la sous-unité, qui a été identifié comme le site actif de la ferroxydase. Le Bfr de Pseudomonas aeruginosa (PaBfr), contrairement aux autres Bfr, ​​contient deux types de sous-unités, qui diffèrent considérablement dans leurs séquences d'acides aminés. Un hétéro-assemblage similaire est observé dans les ferritines des eucaryotes supérieurs. Le Bfr d'Escherichia coli (EcBfr) qui présente naturellement une instabilité structurelle et un comportement d'auto-assemblage incomplet en peuplant deux états d'oligomérisation a été utilisé comme modèle pour des études sur l'auto-assemblage de nano-cages protéiques minimales. APB : 1bfr​APB : 1bcf​
Bactériohopanepolyol/Bacteriohopanepolyol :
Les bactériohopanepolyols (BHP), les bactériohopanoïdes ou les triterpénoïdes pentacycliques bactériens se trouvent couramment dans les membranes cellulaires lipidiques de nombreuses bactéries. Les BHP sont fréquemment utilisés comme biomarqueurs dans les roches sédimentaires et peuvent fournir des informations paléoécologiques sur les anciennes communautés bactériennes.
Analyse_bactériologique de l'eau/Analyse bactériologique de l'eau :
L'analyse bactériologique de l'eau est une méthode d'analyse de l'eau pour estimer le nombre de bactéries présentes et, si nécessaire, pour savoir de quel type de bactéries il s'agit. Il représente un aspect de la qualité de l'eau. Il s'agit d'une procédure d'analyse microbiologique qui utilise des échantillons d'eau et à partir de ces échantillons détermine la concentration de bactéries. Il est alors possible de tirer des conclusions sur l'aptitude de l'eau à être utilisée à partir de ces concentrations. Ce processus est utilisé, par exemple, pour confirmer régulièrement que l'eau est propre à la consommation humaine ou que les eaux de baignade et de loisirs peuvent être utilisées en toute sécurité. L'interprétation et les niveaux de déclenchement d'action pour les différentes eaux varient en fonction de l'utilisation qui est faite de l'eau. Alors que des niveaux très stricts s'appliquent à l'eau potable, des niveaux plus souples s'appliquent aux eaux de baignade marines, où des volumes d'eau beaucoup plus faibles devraient être ingérés par les utilisateurs.
Bactériologiste/Bactériologiste :
Un bactériologiste est un microbiologiste ou un professionnel formé en bactériologie, une subdivision de la microbiologie. Les fonctions d'un bactériologiste comprennent principalement la prévention, le diagnostic et le pronostic des maladies. Parallèlement aux soins de santé, ils peuvent exercer diverses fonctions telles que la surveillance épidémiologique, l'audit qualité avec le développement des biotechnologies, la recherche fondamentale, la gestion et l'enseignement liés à la carrière, la gestion scientifique, la coordination des laboratoires et les banques de sang.
Bactériologie/Bactériologie :
La bactériologie est la branche et la spécialité de la biologie qui étudie la morphologie, l'écologie, la génétique et la biochimie des bactéries ainsi que de nombreux autres aspects qui leur sont liés. Cette subdivision de la microbiologie implique l'identification, la classification et la caractérisation des espèces bactériennes. En raison de la similitude de la pensée et du travail avec des micro-organismes autres que les bactéries, tels que les protozoaires, les champignons et les virus, le domaine de la bactériologie a eu tendance à s'étendre à la microbiologie. Les termes étaient autrefois souvent utilisés de manière interchangeable. Cependant, la bactériologie peut être classée comme une science distincte.
Bactériolysine/Bacteriolysine :
L'une des substances sériques qui fait partie du processus de dissolution des bactéries, les enzymes vont favoriser la dissolution de la paroi cellulaire bactérienne et provoquer la mort des bactéries. La bactériolysine fonctionne probablement en dérégulant l'acide lipotéichoïque (LTA) chez les bactéries Gram-positives et les phospholipides chez les bactéries Gram-négatives.
Bactériome/Bactériome :
Un bactériome est un organe spécialisé, présent principalement chez certains insectes, qui héberge des bactéries endosymbiotiques. Les bactériomes contiennent des cellules spécialisées, appelées bactériocytes, qui fournissent des nutriments et un abri aux bactéries tout en protégeant l'animal hôte. En échange, les bactéries fournissent des éléments essentiels comme des vitamines et des acides aminés à l'insecte hôte. Les bactériomes protègent également les bactéries du système immunitaire de l'hôte, les insectes sécrétant des peptides antimicrobiens tels que la coléoptéricine sécrétée par les charançons pour maintenir les bactéries dans le bactériome. Certains insectes, comme le tireur d'élite aux ailes vitreuses, hébergent plus d'une espèce de bactéries. Chez les cochenilles blindées, les bactériomes ont des propriétés génétiques et sexuelles uniques. Par exemple, ils ont cinq copies de chaque chromosome, dont deux copies du génome complet de la mère.]
Bactériophage/Bactériophage :
Un bactériophage (), également connu de manière informelle sous le nom de phage (), est un virus qui infecte et se réplique dans les bactéries et les archées. Le terme est dérivé de "bactéries" et du grec φαγεῖν (phagein), signifiant "dévorer". Les bactériophages sont composés de protéines qui encapsulent un génome d'ADN ou d'ARN et peuvent avoir des structures simples ou élaborées. Leurs génomes peuvent coder aussi peu que quatre gènes (par exemple MS2) et jusqu'à des centaines de gènes. Les phages se répliquent au sein de la bactérie suite à l'injection de leur génome dans son cytoplasme. Les bactériophages sont parmi les entités les plus courantes et les plus diverses de la biosphère. Les bactériophages sont des virus omniprésents, présents partout où existent des bactéries. On estime qu'il y a plus de 1031 bactériophages sur la planète, plus que tous les autres organismes sur Terre, y compris les bactéries, combinés. Les virus sont l'entité biologique la plus abondante dans la colonne d'eau des océans du monde, et le deuxième plus grand composant de la biomasse après les procaryotes, où jusqu'à 9x108 virions par millilitre ont été trouvés dans des tapis microbiens à la surface, et jusqu'à 70% des les bactéries peuvent être infectées par des phages. Les phages sont utilisés depuis la fin du XXe siècle comme alternative aux antibiotiques dans l'ex-Union soviétique et en Europe centrale, ainsi qu'en France. Ils sont considérés comme une thérapie possible contre les souches multirésistantes de nombreuses bactéries (voir phagothérapie). Les phages sont connus pour interagir avec le système immunitaire à la fois indirectement via l'expression bactérienne de protéines codées par les phages et directement en influençant l'immunité innée et la clairance bactérienne.
Bactériophage AP205/Bactériophage AP205 :
Le bactériophage AP205 est un bactériophage qui infecte les bactéries Acinetobacter. Contient un génome linéaire d'ARN simple brin positif. Le bactériophage appartient au genre Apeevirus de la famille des Duinviridae et est l'espèce type de la famille.
Bactériophage Giles/Bactériophage Giles :
Giles est un bactériophage qui infecte la bactérie Mycobacterium smegmatis. Le génome de ce phage est très différent de celui des autres mycobactériophages et est fortement mosaïque. Plus de la moitié de ses gènes prédits sont nouveaux et ne sont pas observés chez d'autres espèces.
Bactériophage MS2/Bactériophage MS2 :
Le bactériophage MS2 (Emesvirus zinderi), communément appelé MS2, est un virus à ARN simple brin icosaédrique de sens positif qui infecte la bactérie Escherichia coli et d'autres membres des Enterobacteriaceae. MS2 fait partie d'une famille de virus bactériens étroitement apparentés qui comprend le bactériophage f2, le bactériophage Qβ, R17 et GA.
Bactériophage Mu/Bactériophage Mu :
Le bactériophage Mu, également connu sous le nom de phage mu ou bactériophage mu, est un muvirus (le premier du genre à être identifié) de la famille des Myoviridae dont il a été démontré qu'il provoque une transposition génétique. Il revêt une importance particulière car sa découverte chez Escherichia coli par Larry Taylor a été l'une des premières observations d'éléments d'insertion dans un génome. Cette découverte a ouvert le monde à une enquête sur les éléments transposables et leurs effets sur une grande variété d'organismes. Alors que Mu était spécifiquement impliqué dans plusieurs domaines de recherche distincts (y compris E. coli, le maïs et le VIH), les implications plus larges de la transposition et de l'insertion ont transformé l'ensemble du domaine de la génétique.
Bactériophage P2/Bactériophage P2 :
Le bactériophage P2, nom scientifique Escherichia virus P2, est un phage tempéré qui infecte E. coli. C'est un virus à queue à gaine contractile et est donc classé dans le genre Peduovirus (anciennement P2likevirus), sous-famille des Peduovirinae, famille des Myoviridae au sein de l'ordre des Caudovirales. Ce genre de virus comprend de nombreux phages de type P2 ainsi que le phage satellite P4.
Bactériophage PBC1/Bactériophage PBC1 :
Le bactériophage PBC1 est un bactériophage qui infecte la bactérie sporulée Bacillus cereus.
Bactériophage Qbeta/Bactériophage Qbeta :
Le bactériophage Qbeta (Qubevirus durum), communément appelé Qbeta ou Qβ, est un virus à ARN à brin positif qui infecte les bactéries qui ont F-pili, le plus souvent Escherichia coli. Son génome linéaire est conditionné dans une capside icosaédrique d'un diamètre de 28 nm. Le bactériophage Qβ pénètre dans sa cellule hôte après s'être lié au côté du pilus F.
Bactériophage T12/Bactériophage T12 :
Le bactériophage T12 est un bactériophage qui infecte l'espèce bactérienne Streptococcus pyogenes. Il s'agit d'une espèce proposée de la famille des Siphoviridae dans l'ordre des Caudovirales (virus à structure tête-queue). Il convertit une souche inoffensive de bactéries en une souche virulente. Il porte le gène speA qui code pour la toxine érythrogénique A. speA est également connu sous le nom d'exotoxine A pyogénique streptococcique, de toxine A de la scarlatine ou encore de toxine scarlatine. Notez que le nom du gène « speA » est en italique ; le nom de la toxine "speA" n'est pas en italique. La toxine érythrogénique A convertit une souche inoffensive et non virulente de Streptococcus pyogenes en une souche virulente par lysogénie, un cycle de vie caractérisé par la capacité du génome à devenir une partie de la cellule hôte et à y être maintenu de manière stable pendant des générations. Les phages à cycle de vie lysogène sont également appelés phages tempérés. Le bactériophage T12, membre proposé de la famille des Siphoviridae, y compris les bactériophages porteurs de speA apparentés, est également un phage prototype pour tous les phages porteurs de speA de Streptococcus pyogenes, ce qui signifie que son génome est le prototype des génomes de tous ces phages de S. pyogenes. C'est le principal suspect comme cause de la scarlatine, une maladie infectieuse qui touche les jeunes enfants.
Bactériophage experimental_evolution/Évolution expérimentale du bactériophage :
Les études expérimentales sur l'évolution sont un moyen de tester la théorie de l'évolution dans le cadre d'expériences soigneusement conçues et reproductibles. Avec suffisamment de temps, d'espace et d'argent, n'importe quel organisme pourrait être utilisé pour des études expérimentales sur l'évolution. Cependant, ceux avec des temps de génération rapides, des taux de mutation élevés, de grandes tailles de population et de petites tailles augmentent la faisabilité des études expérimentales dans un contexte de laboratoire. Pour ces raisons, les bactériophages (c'est-à-dire les virus qui infectent les bactéries) sont particulièrement favorisés par les biologistes évolutionnistes expérimentaux. Les bactériophages et les organismes microbiens peuvent être congelés en stase, ce qui facilite la comparaison des souches évoluées aux ancêtres. De plus, les microbes sont particulièrement labiles du point de vue de la biologie moléculaire. De nombreux outils moléculaires ont été développés pour manipuler le matériel génétique des organismes microbiens et, en raison de la petite taille de leur génome, le séquençage des génomes complets de souches évoluées est trivial. Par conséquent, des comparaisons peuvent être faites pour les changements moléculaires exacts dans les souches évoluées lors de l'adaptation à de nouvelles conditions.
Bactériophage f2/Bactériophage f2 :
Le bactériophage f2 est un virus à ARN simple brin icosaédrique de sens positif qui infecte la bactérie Escherichia coli. Il est étroitement apparenté au bactériophage MS2 et attribué à la même espèce.
ARNp bactériophage/ARNp bactériophage :
L'ARNp du bactériophage est un élément de l'ARNnc. Au cours de la réplication des virus à ADNdb linéaires, le génome viral est empaqueté dans la procapside virale préformée. L'emballage de l'ADN dans la procapside nécessite un moteur moléculaire, qui utilise l'ATP comme énergie pour accomplir le mouvement énergétiquement défavorable. Chez certains bactériophages, une molécule d'ARN (ARNp) est un composant vital de ce moteur. Les analyses structurelles du moteur d'emballage ont démontré que la molécule d'ARNp a une symétrie quintuple lorsqu'elle est attachée à la prohead. On pense que l'ARNp est lié par la protéine de connexion de la capside. Seules les 120 premières bases de l'ARNp sont essentielles pour emballer l'ADN viral. Il est proposé que l'ARNp soit composé de deux domaines, l'un correspondant aux 120 premières bases et le second aux 50 bases restantes. Le clivage nucléaire se produit dans la région simple brin reliant ces deux domaines.
Protéines d'échafaudage de bactériophage/Protéines d'échafaudage de bactériophage :
En biologie moléculaire, les protéines d'échafaudage des bactériophages sont des protéines impliquées dans l'assemblage des bactériophages. L'assemblage d'une structure macromoléculaire se déroule via une voie spécifique d'événements ordonnés et implique des changements conformationnels dans les protéines lorsqu'elles rejoignent l'assemblage. Le processus d'assemblage est facilité par des protéines d'échafaudage, qui agissent comme des chaperons. Chez les bactériophages, les protéines d'échafaudage B et D sont responsables de la formation de la procapside. 240 copies de la protéine D forment l'échafaudage externe, tandis que 60 copies de la protéine B forment l'échafaudage interne. Le rôle de la protéine d'échafaudage D est dans la production d'ARN viral simple brin.
Bactériophage %CF%86Cb5/Bactériophage φCb5 :
Le bactériophage φCb5 est un bactériophage qui infecte les bactéries Caulobacter et d'autres caulobactéries. Le bactériophage a été découvert en 1970, il appartient au genre Cebevirus de la famille des Steitzviridae et est l'espèce type de la famille. Le bactériophage est largement distribué dans le sol, les lacs d'eau douce, les ruisseaux et l'eau de mer, des endroits où les caulobactéries habitent et peuvent être sensibles à la salinité.
Bactérioplans/Bacterioplanes :
Bacterioplanes est un genre de bactérie de la famille des Oceanospirillaceae, avec une espèce connue (Bacterioplanes sanyensis).
Bacterioplanes sanyensis/Bacterioplanes sanyensis :
Bacterioplanes sanyensis est une bactérie Gram-négative du genre Bacterioplanes qui a été isolée d'un pool avec des cyanobactéries Spirulina plantensis à Sanya en Chine.
Bactérioplancton/Bacterioplancton :
Le bactérioplancton fait référence à la composante bactérienne du plancton qui dérive dans la colonne d'eau. Le nom vient du mot grec ancien πλανκτος (planktos), signifiant « vagabond » ou « vagabond », et bactérie, un terme latin inventé au 19ème siècle par Christian Gottfried Ehrenberg. On les trouve aussi bien en eau de mer qu'en eau douce. Le bactérioplancton occupe une gamme de niches écologiques dans les écosystèmes marins et aquatiques. Ils sont à la fois producteurs primaires et consommateurs primaires dans ces écosystèmes et sont à l'origine du cycle biogéochimique mondial des éléments essentiels à la vie (par exemple, le carbone et l'azote). De nombreuses espèces de bactérioplancton sont autotrophes et tirent leur énergie de la photosynthèse ou de la chimiosynthèse. Le bactérioplancton photosynthétique est souvent classé dans la catégorie du picophytoplancton et comprend les principaux groupes de cyanobactéries tels que Prochlorococcus et Synechococcus. D'autres bactérioplanctons hétérotrophes sont saprotrophes et obtiennent de l'énergie en consommant de la matière organique produite par d'autres organismes. Ce matériau peut être dissous dans le milieu et prélevé directement à partir de celui-ci, ou des bactéries peuvent vivre et se développer en association avec un matériau particulaire tel que la neige marine. Le bactérioplancton joue un rôle essentiel dans la fixation globale de l'azote, la nitrification, la dénitrification, la reminéralisation et la méthanogénèse. L'abondance du bactérioplancton dépend de variables environnementales telles que la température, la disponibilité des nutriments et la prédation. Comme d'autres petits planctons, le bactérioplancton est la proie du zooplancton (généralement des protozoaires) et leur nombre est également contrôlé par l'infection par des bactériophages.
Bacterioplankton counting_methods/Méthodes de comptage du bactérioplancton :
Le comptage du bactérioplancton est l'estimation de l'abondance du bactérioplancton dans un plan d'eau spécifique, qui est une information utile aux microbiologistes marins. Diverses méthodologies de comptage ont été développées au fil des ans pour déterminer le nombre présent dans l'eau observée. Les méthodes utilisées pour compter le bactérioplancton comprennent la microscopie à épifluorescence, la cytométrie en flux, les mesures de productivité par la fréquence des cellules en division (FDC), l'incorporation de thymidine et l'incorporation de leucine. Des facteurs tels que la salinité, la température, la latitude, divers niveaux de nutriments, le mouvement de l'eau et la présence d'autres organismes peuvent affecter le dénombrement du bactérioplancton. Les changements de ces facteurs affectent le nombre de bactérioplanctons, le faisant varier selon le plan d'eau, l'emplacement, la distance du rivage et la saison. Le nombre de bactérioplanctons est généralement exprimé en cellules par ml (cellules ml−1).
Bactérioplanoïdes/Bacterioplanoïdes :
Bacterioplanoides est un genre de bactérie de la famille des Oceanospirillaceae avec une espèce connue (Bacterioplanoides pacificum).
Bacterioplanoides pacificum/Bacterioplanoides pacificum :
Bacterioplanoides pacificum est une bactérie à Gram négatif, strictement aérobie et mobile du genre Bacterioplanoides avec un seul flagelle polaire qui a été isolée du gyre du Pacifique Sud.
Bactériorhodopsine/Bacteriorhodopsine :
La bactériorhodopsine est une protéine utilisée par les Archaea, notamment par les haloarchaea, une classe des Euryarchaeota. Il agit comme une pompe à protons ; c'est-à-dire qu'il capte l'énergie lumineuse et l'utilise pour déplacer les protons à travers la membrane hors de la cellule. Le gradient de protons résultant est ensuite converti en énergie chimique.
Agent bactériostatique/Agent bactériostatique :
Un agent bactériostatique ou bactériostatique, en abrégé Bstatique, est un agent biologique ou chimique qui empêche les bactéries de se reproduire, sans nécessairement les tuer autrement. Selon leur application, on distingue les antibiotiques bactériostatiques, les désinfectants, les antiseptiques et les conservateurs. Lorsque des antimicrobiens bactériostatiques sont utilisés, la durée du traitement doit être suffisante pour permettre aux mécanismes de défense de l'hôte d'éradiquer la bactérie. Lors du retrait du bactériostat, les bactéries commencent généralement à se développer rapidement. Cela contraste avec les bactéricides, qui tuent les bactéries. Les bactériostatiques sont souvent utilisés dans les plastiques pour empêcher la croissance des bactéries sur les surfaces. Les bactériostatiques couramment utilisés dans les travaux de laboratoire comprennent l'azide de sodium (qui est extrêmement toxique) et le thiomersal.
Bactériothérapie/Bactériothérapie :
La bactériothérapie est l'utilisation délibérée de bactéries ou de leurs produits dans le traitement d'une maladie. Les formes de bactériothérapie comprennent l'utilisation de probiotiques, des micro-organismes qui procurent des bienfaits pour la santé lorsqu'ils sont consommés; les greffes de matières fécales (FMT)/greffe de microbiote intestinal (IMT), le transfert de micro-organismes intestinaux de la matière fécale de donneurs sains vers des patients receveurs pour restaurer le microbiote ; ou des symbiotiques qui combinent des prébiotiques, des ingrédients non digestibles qui favorisent la croissance de micro-organismes bénéfiques et des probiotiques. Grâce à ces méthodes, le microbiote intestinal, la communauté de 300 à 500 espèces de micro-organismes qui vivent dans le tube digestif des animaux aidant à la digestion, au stockage de l'énergie, à la fonction immunitaire et à la protection contre les agents pathogènes, peut être recolonisé avec des bactéries favorables, qui à leur tour ont des effets thérapeutiques. effets.FMT est utilisé comme un traitement nouveau et efficace pour les infections à C. diff, une maladie gastro-intestinale dans laquelle Clostridium difficile colonise l'intestin d'un organisme perturbant l'équilibre microbien et provoquant une diarrhée potentiellement mortelle. La bactériothérapie a également commencé à être utilisée dans le traitement des troubles mentaux tels que la dépression, l'anxiété et les troubles du spectre autistique. La recolonisation de la flore intestinale peut être utilisée efficacement dans le traitement des troubles mentaux en raison de l'existence de l'axe intestin-cerveau, la voie de communication bidirectionnelle entre le cerveau et l'intestin, en particulier le microbiote intestinal.
Bacteriovoracaceae/Bacteriovoracaceae :
Les Bacteriovoracaceae sont une famille de bactéries gram-négatives en forme de virgule. Tous les membres ont un cycle de vie en deux parties consistant en une "phase d'attaque" mobile et une "phase prédatrice" qui vit dans le périplasme d'autres bactéries gram-négatives. Les bactériivoracées se trouvent dans l'eau douce et dans le sol.
Bactériivoracales/Bacteriovoracales :
Les Bacteriovoracales sont un ordre de bactéries.
Bactériovorax/Bacteriovorax :
Bacteriovorax est un genre contenant une seule espèce de bactérie de la famille des Bacteriovoracaceae, Bacteriovorax stolpii. C'est un prédateur qui se nourrit de plus grosses bactéries Gram-négatives. Ces bactéries proies ont tendance à vivre dans des environnements entériques et ont des structures lipopolysaccharidiques similaires. Bacteriovorax stolpii reconnaît sa proie par les récepteurs protéiques de la membrane externe, ce qui explique pourquoi les bactéries Gram-positives dépourvues de membrane externe ne servent pas de proie. Ils s'attaquent aux bactéries en envahissant l'espace interpériplasmique où ils se nourrissent, grandissent et se reproduisent. Bacteriovorax stolpii était autrefois classé dans le genre Bdellovibrio en raison de morphologies et de caractéristiques de mode de vie similaires, mais ils ont été reconnus comme un nouveau genre par analyse phylogénétique.
Bactérie (homonymie)/Bactérie (homonymie) :
Bactérie peut faire référence à : Forme singulière de bactérie Bactérie (genre) Bactérie (film), un film de 2006
Bactérie (genre)/Bactérie (genre) :
Le genre Bacterium était un taxon décrit en 1828 par Christian Gottfried Ehrenberg. L'espèce type a ensuite été changée de Bacterium triloculare à Bacterium coli (maintenant Escherichia coli) car elle a été perdue. En 1951 puis en 1954, il fut reconnu comme nomen generum rejiciendum, c'est-à-dire un nom générique à rejeter ; cela s'appliquait également à sa famille Bacteriaceae. Ce genre comprenait des tiges non sporulées dont la relation avec d'autres espèces était obscure («un groupe de dumping de taxonomie»). Ceci est différent du genre Bacillus, dont les membres étaient des bâtonnets formant des spores (sensu Cohn 1872).

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